В настоящий момент очевидным является тот факт, что кормовые антибиотики превосходят по эффективности каждую отдельную альтернативу.  Поиск решений должен быть связан с разработкой комплекса мероприятий, которые могли бы своим синергитичным  эффектом добиться необходимых показателей по профилактике инфекционных заболеваний.  Одной из наиболее трудных задач является возможность оценить эффективность и дальнейшие перспективы каждого из средств, предназначенных для оптимизации микрофлоры желудочно-кишечного тракта сельскохозяйственных животных (эубиотиков).

В открытом доступе находятся, в основном, результаты исследований с использованием т.н. «негативного контроля», т.е. без сравнения с конкурирующими группами препаратов. В ходе испытаний животных разделяют на две группы: контрольную (которой не дают никаких добавок для коррекции микрофлоры, в том числе кормовых антибиотиков) и опытную (который вводят в корм пробиотики). Однако результаты подобных испытаний не позволяют сопоставить эффективность пробиотиков и кормовых антибиотиков. 

Те немногие исследования, которые сравнивают пробиотики и кормовые антибиотики, в качестве последнего используют виргиниамицин, неомицин и полимиксин. Сопоставление эффектов пробиотиков и антибиотиков дает возможность сделать следующие выводы:

- Действие кормовых антибиотиков на повышение массы тела проявляются быстрее, чем действие пробиотиков. Эффект отложенного результата наблюдается на всех видах животных: птице, КРС и свиньях. Этот факт может быть обусловлен различиями в механизмах воздействия пробиотиков и антибиотиков. 

- В некоторых случая пробиотики демонстрируют сопоставимые с антибиотиками эффекты стимуляции прироста и увеличения конверсии корма

- Пробиотики, в отличие от антибиотиков,  способны оказывать позитивный эффект на иммунную систему организма, в том числе за счет стимуляции белых кровяных тел

- Пробиотики способны