Американские учёные детально изучили и описали структуру гексогональных строительных протеинов (CA), которые формируют капсид вируса иммунодефицита человека. Учёные надеются, что знание детального строения оболочки вируса поможет им обнаружить эффективные пути блокирования проникновения вируса в клетку.
Известно, что наружная оболочка вируса иммунодефицита (капсид) состоит из 250 гексагональных строительных белков.
Профессор Марк Йегер (Mark Yeager) и его коллеги из Исследовательского института Скрипса, Калифорния (The Scripps Research Institute), Университета штата Виргиния (University of Virginia) и Университета штата Юта (University of Utah) использовали комплексную методику, сочетающую в себе методы молекулярной биологии, биохимии, электронной микроскопии и рентгеновской кристаллографии. На основе полученных данных учёным удалось синтезировать стабильные гексамеры строительных белков CA.
В белках СА цепочки аминокислот разветвляются в несколько направлений, так называемые а-спирали, и расширяются, в местах взаимодействия с другими участками протеина. Учёные выявили положение этих а-спиралей в пространстве и смогли определить все типы взаимодействий боковых цепей, которые стабилизируют гексамер. Центр гексамерной структуры образован шестью N-концами белков, а С-концы формируют гибкий «пояс» вокруг центра. Эта эластичность позволяет формировать структуру, подобную пчелиным сотам. Ещё один тип взаимодействий, обеспечивающий стабильность конусообразной структуры капсида, это связь между N- и С-концами протеинов соседних гексамеров.
Знание строения и типов связей между структурными белками, формирующими капсид вируса иммунодефицита, позволят найти эффективные пути блокирования, дестабилизации и разрушения оболочки вируса.